临床主要用于治疗功能性便秘、肺心病心力衰竭、功能性消化不良等病症。

1.功能性便秘：以四磨汤联用生物制剂金双歧治疗老年人功能性便秘42例，与常规果导片、麻仁丸等对症治疗相对照，疗程4周。以排便次数、排便费力程度及相关症状为疗效标准，结果：治疗组显效26例，好转13例，无效3例，总有效率92.8%。(《陕西中医》2002年第1期)

2.肺心病心力衰竭：以四磨汤联合硝苯吡啶缓释片治疗肺心病心力衰竭患者48例，并与常规西药治疗相对照，疗程14日。以心悸、胸闷、气促、发绀等基本症状及心功能变化为疗效评价标准。结果：治疗组显效31例，有效15例，无效2例，总有效率95.8%。(《山东医药》2010年第14期)

3.功能性消化不良：以加味四磨汤治疗功能性消化不良患者60例，疗程4周。比较治疗前后症状积分、血浆及胃黏膜hrelin表达的变化一结果：临床总有效率64.28%,临床痊愈12例，显效16例，有效8例，无效20例。患者hrelin血浆含量及胃黏膜表达呈上升变化，较治疗前有统计学差异。(《中国中医药科技》2013年第3期)