体外实验表明，载脂蛋白B是难溶于水的蛋白质。目前所知，ApoB族可分为两个亚类，即ApoB₄₈和ApoB₁₀₀。ApoB主要成份是B₁₀₀，其次为B₄₈，其他形式如ApoB₇₅，ApoB₄₁，ApoB₃₆等均为ApoB₁₀₀的不同降解产物。