肠道病毒属于微小核糖核酸病毒科（Picornaviridae）,本属病毒具有相同的理化生物学特性（详见脊髓灰质炎章）。根据致新生小白鼠病变特点，可将柯萨奇病毒分为A、B两群。A群可使鼠发生广泛的骨髓肌肌炎及坏死，引起弛缓性瘫痪，此群有24个血清型；B群已发现6个血清型，可引起乳鼠局灶性肌炎、心肌炎、肝炎、脑炎等。埃可病毒现有1～34型，但其中8、10、28、34型已归入其它病毒，仅对人有感染性，而对乳鼠不致病，猴肾及人肾细胞对埃可病毒敏感，可用来分离病毒。自1968年以来又发现不能以现有肠道病毒免疫血清中和的新型肠道病毒68-71型。