治疗消化道疾病使用范围较广的激光有CO2激光及Nd：YAG激光。治疗可分开放式手术和闭合式手术。前者按外科操作程序进行，以光刀取代钢刀；后者借助最先进的消化道内窥镜于直视下手术，当然只有使用Nd：YAG激光的石英纤维才能将激光导入。而CO2激光还无法经光纤导入。至于使用何方式手术应视病情及具体情况而定，作者曾用CO2激光行胃切除及直肠根治术。目前在外科领域，应用较多的是内窥镜下激光治疗消化道出血和肿瘤。