CMV感染的自然史很复杂，在原发性感染以后排毒，往往持续数周、数月甚至数年，然后感染转为潜伏。常有复发感染伴重新排毒。甚至在原发感染后很多年，潜伏病毒再激活，也可能有不同抗原性病毒株的再感染。CMV感染的临床表现与个体免疫功能和年龄有关。从表2所示，不论从垂直感染、平行传播或医源性感染所出现的症状与体征都是多种多样的。

表2　CMV感染症临床经过与病型（Baerlocher等）

1.新生儿感染（先天性）
a.重症型：黄疸、贫血、肝脾肿大、血小板减少性紫癜，侵犯中枢神经，肺炎，心肌炎）
b.轻症型：假死，心脏肥大，高胆红素血症
2．出生后无症状期，乳儿期再感染CMV（先天性/后天性？）
a.全身型
b.呼吸系型（百日咳样）c.肝脾肿大
d.胃肠型
e.肾型？
3．后天型
a.流感型
b.单核细胞增多症型
c.呼吸系型
d.胃肠型
e.肝炎
f.因特殊医疗防御能力低下
g.无症型？
4．1、2、3项的后果即精神、运动发育迟缓

关于后天性CMV感染症，在临床中常见于输血后的单核细胞增多症，由于免疫功能缺陷而发生血管、网膜炎、肺炎以及消化道感染。并且大多数患者合并格-巴氏综合征。