因为PCR检测Hp的敏感性高、特异性强、检查快速；HindⅢ限制性内切酶可以分析Hp全基因差异，可以用它来鉴定Hp菌株，所以分子生物学技术作为Hp流行病学的研究工具，其敏感性和特异性远远超过Hp的常规检查法，因而有利于确定Hp感染的来源和途径。Langenberg等报道1例在前几次胃镜检查时经细菌培养和组织学检查证明为Hp阴性的患者，在进行另一次胃镜检查后则变为Hp阳性。经DNA内切酶分析发现其HpDNA酶切图型完全相同，证明了经内镜检查而引起人与人之间的医源性传播。宋敏等用巢式PCR从唾液中检出了Hp，说明口—口的传播可能是Hp在人与人之间传播的另一条途径。