这一类方法主要是利用让患者口服同位素标记的尿素，以观察胃中Hp分解尿素的能力，籍此判断患者是否感了Hp及其感染的程度，这类试验现有两类三种。

3.1　呼气试验

这一类试验首先是Graham根据上述道理设计，于1987年首次报道的。他用的是稳定性同位素¹³C标记的尿素，让患者口服后，尿素在胃中接触Hp的尿素酶后分俀成¹³CO₂，测定其在CO₂总呼出量中所占的浓度，以判断胃中是否感染了Hp和感染的程度。这一种方法的最大优点是：①体内测定胃内感染Hp的总体情况，避免了活检标本Hp分布不均造成的假阴性的结果；②¹³C是一种稳定性同位素，所以对机体是完全无损伤性的；③它除了定性以外，还可做定量测定。它的最大弱点是需用气体同位素质谱仪测定，这种设备是一般医院内不具备的贵重仪器，再加上¹³C是稀有元素，因此测试费用较贵。后来Bell设计了用¹⁴C标记的尿素让患者口服，用闪烁扫描仪测定患者呼出的¹⁴CO₂，这种仪器在有核医学科的医院中一般都有，因此在医院中测定较方便。但是¹⁴C是一种放性同位素，尽管它的价格不是太贵，射线也不是太强，但它的半衰期有5000⁺a，一旦被机体摄入，有可能对机体造成慢性的长期的内照射损伤，因此这试验对孕妇有小孩特别不宜使用，尽管它的优点类同于¹³CO₂呼气试验，即使对成人亦应慎重使用。

3.2　15N-尿素排出试验

这一试验是我国吴继宗等人利用类似的原理在国际上首创的，其方法是用¹⁵N标记的尿素供患者口服，然后收集2h尿检出其¹⁵N－尿氨的排出率，以判断胃内Hp感染程度。这一试验具有¹³CO₂呼气试验同样的优点，它是无损伤性的，不需作胃镜，亦无放射性损伤；它是无损伤性的，不需作胃镜，亦无放射性损伤；它的敏感性特异性高，是定量的，且是反映整个胃的感染情况，克服了活检标本采样有损伤性和分布不均的缺点，采样比呼气试验方便，测定的准确性较高，缺点与¹³C－呼气试验相同，检测需用质谱仪，检测费用较高，但是¹⁵N－尿素比¹³C－尿素要便宜得多，且有国产的，因此在必要时仍然是一种可以推广使用的方法。例如：孕妇、小孩、老年人需要诊断Hp感染但不宜作胃镜或是¹⁴C－呼气试验检查时；为了鉴定一种抗Hp药物究竟有没有体内疗效及没有胃病主诉但需要发解有无Hp感染的人等等。近年来对功能性胃消化不良究竟是否与Hp感染有关，临床上争论不休，可能¹⁵N－尿氨排出试验是研究这一问题的最好方法之一¹²。由于¹⁵N－尿氨排出试验是一种尿素在胃内分解后，¹⁵N经吸收通过肾脏由尿排出的试验，因此有严重肝肾功能损害者不宜使用。