Hp是突出的特点之一是具有活性很高的尿素酶，有人认为它同该菌的致病性和耐酸能力有关，而尿素酶的分子结构则与其免疫学特性密切相关。

Hu和Mobley研究了尿素酶的分子结构，将经柱层析纯化的尿素酶进行分析，证明纯化的尿素酶所占Hp菌体粗提取物可溶性蛋白5.9%,Mr为550 000,由两个Mr分别为66000和29 500的亚单位组成,两者在分子中的比例约为1:1，6对这样的亚单位构成一个基本的酶分子。并推测Hp强大的尿素酶活力是由于大量的尿素酶分子作用的结果，而不是单一酶分子活性特别高。

N-末端分析显示29 500亚单位氨基酸顺序上同刀豆尿素酶亚单位的氨基末端以及奇异变形杆菌和摩氏摩根菌（Morganella morganii）尿素酶3个亚单位中最小者具有很高的相似性。66 000亚单位同奇异变形杆菌、摩氏摩根菌和产生气克雷白杆菌尿素酶3个亚单位中最大者具有相似的内顺序（氨基酸271～285）。再者，摩氏摩根菌和刀豆的尿素酶亚单位可被Hp66000亚单位的特异性抗血清所识别。从而表明至少有部分相同的抗原决定簇留在不同种系的尿素酶中。

目前国内外已有用粗制尿素酶提取物做ELISA的包被抗原检测血清中的Hp抗体。由于分子结构的相似性及存在相同的抗原决定簇，用尿素酶提取物作抗原在临床上诊断Hp感染，有可能同含有尿素酶的其他菌群发生交叉反应，如泌尿道菌群等。但这种交叉是否严重到影响临床诊断、以及交叉频度、范围等问题，尚有待进一步的研究。