ApoE是LDL受体的配体，其表型不同，与LDL受体的能力也不同，E4和E3几乎相同，E2几乎无结合能力。E2纯合子因为第158氨基酸残基突变，因为CM残粒或β-VLDL的滞留而导致高Ch，TG血症高脂蛋白血症，易出现早期动脉硬化，典型例子是家族性Ⅲ型高脂血症，ε2基因纯合子人群分布频率为1%，家庭性Ⅲ型高脂血症发病率为一万人有2～3人，究其原因，ApoE2纯合子遗传因素是主要的，然而还与环境因素等的影响如甲状腺机能亢进肿瘤以及家族性复合型高脂蛋白血症等。ApoE突变点的主要位点如表10-6所示。

表10-6 主要ApoE突变点

突变部位 IEF泳动位置 基因频率 受体结合活性（%） Ⅲ型高脂血症遗传形式
E3（野生型） EⅢ 0.825 100 —
E4（Cys112→Arg） EⅣ 0.102 100 —
E2（Arg156→Cys） EⅡ 0.066 ＜2 隐性
E5（Glu3→Lys） EⅤ 0.005 217 —
E7（Glu244→Lys，Glu245→Lys） EⅥ 0.002 23 —
Arg136→ser EⅡ (2) 40 不明
Arg142→Cys EⅢ (1) ＜2 显性
Arg142→Cys EⅢ (4) 45 不明
Lys146→Gln EⅡ (4) 40 显性
Lys146→Gln EⅠ (1) ？ 显性
7氨基酸缺失（121-127） EⅢ (3) 25 显性

（源自Mahley R W,1991）